オランダ坂の小道を入り込んだ先にある洋館の喫茶店、cafe「小夜時雨」。雨の降る夜、偶然迷い込んだ女子大生は、変わり者の店主と出会う。

不思議なこだわりのある喫茶店、cafe「小夜時雨」……そこで長崎のさまざまな伝統菓子を知ることになった。

やがて彼女は店で働くようになったが、店主には驚くべき秘密があり――。

美味しいお菓子が繋ぐ、甘いだけではない交流が今、始まる。